Qvest Выбор программы влияет на удобство создания/импорта/отправки/получения но не имеет совершенно никакого отношения к скорости получения Вами квитанций.
И тем более, не путайте отчет и договор. Отчеты обрабатываются автоматически, тогда как договора проходят процедуру ручного визирования. В самих налоговых (причем во всех по разному) могут принять некий внутренний регламент, как поступать с договорами, из-за чего какая то налоговая предпринимателям+неплательщикам НДС может подписывать практически сразу, а другая будет тянуть резину все пять разрешенных дней.