это параметр, при упоминании которого сбрасываются все фильтры для раздела. Что значит "сделать привязку" ? Я убрал из ссылки "?flush_all_fiters".

Нужно ли сделать фильтры слева (ссылки типа http://www.goldapple.in.ua/catalog/3...i.htm?add=1-45 или http://www.goldapple.in.ua/catalog/3...tm?remove=1-45) без использования элементов <a></a> ?

Я как-то не задумывался особо над этим, если нужно - то тоже можно сделать.
нельзя их оставлять безссылочными . Их надо привести к виду www.goldapple.in.ua/catalog/sumki/"brend"/
Реально, как не крути, а все равно такая структура даст больше пользы. Понимаю - гимор с индексом.Понимаю - переписывать структуру, и с контентом заморачиваться. Но иного я советовать не могу =(. Остальные телодвижения - это бубен, причем который в итоге аукнется.

поместить этот блок в nofollow ?
Я бы ставил. Лишний шлак не стоит скармливать ПСам.