Подтверждаю, что через турфирму действительно получится дешевле. Как правило это будет незатейливая гостиница на окраине, но рядом со станцией метро. Самому найти в Питере приемлимое по цене жилье будет нереально.
Вообще время для путешествия вы выбрали неудачное. Фонтаны в Петергофе уже закрылись, навигация по Неве хоть и открыта, но на речных травайчиках кататься будет мягко скажем будет некомфортно. Каждый день с неба что-то капает, вобщем мерзкая и противная погода.
Рекомендую ехать с мая по август. Сам был в этом году в мае - попал на открытие фонтанов (очень красивое шоу). И с погодой повезло - все пять дней было солнце, что вообще нехарактерно для Питера.
До Питера лучше всего ехать "восьмеркой" через Синельниково, он проходящий поэтому билеты надо брать заранее. В пути ровно сутки. Прямой Днепр-Питер не рекомендую - едет две ночи, потому как делает крюк в Беларусь. Да и сам поезд грязнее.