Вариантов почему может долго грузиться масса
От банального засирания системы и стад вирусни по всем углам, до проблем с жестким диском, памятью или материнкой
Советы по использованию твикеров и прочих чистилок реестров - это очень плохие советы, при незнании можно упороть систему вообще

В первую очередь проверьте систему на вирусы
Или из безопасного режима или с live CD
Брать антивирусные сканеры тут:
http://devbuilds.kaspersky-labs.com/devbuilds/AVPTool/
http://www.freedrweb.com/download+cureit/gr/


Затем проверить автозагрузку, возможно у вас там все подряд грузится
Для этого
win+R -> msconfig - вкладка "автозагрузка". Поснимать галки со всякого мусора
Если чего нужное отключили, то включать там же

Загляните в системный блок, возможно в нем скопилась гора пыли и кошачьей шерсти, которую немедленно надо удалить, предварительно обесточив ПК из розетки. При перегреве компоненты компьютера могут снижать свои показатели, что выливается в потерю производительности.

Если не помогло, то загрузить Hiren's Live CD
Проверить винчестер через mhdd или victoria
И оперативку через memtest
Возможно, проблема аппаратная

Если тесты не выявили проблем, вы почистили от вирусни и автозапуски, то у вас два варианта осталось:
- отдать специалистам на разбор полетов
- самостоятельно переставить винду
Как переставлять винду здесь инструкция, контакты специалистов - у меня в подписи